RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ZFP42Q96MM3 310 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 APOL6Q9BWW8 343 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CDT1Q9H211 546 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 SNTG2Q9NY99 539 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 H0YCG3 227 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 K7ENM7 598 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 DDHD2O94830 711 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 SLFN14P0C7P3 912 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB1P25685 340 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PBX3P40426 434 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA8P51970 172 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ZPBP2Q6X784 338 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CEP120Q8N960 986 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PANK4Q9NVE7 773 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.46■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.45■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.45■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PIGRP01833 764 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 IDEP14735 1019 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GAP43P17677 238 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SCP2P22307 547 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MLH1P40692 756 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 STRN3Q13033 797 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 KLK14Q9P0G3 267 aa24.45■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TOM1L1O75674 476 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 POMCP01189 267 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 LAG3P18627 525 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CASP5P51878 434 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 EHHADHQ08426 723 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 PAGE5Q96GU1 130 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 PARP2Q9UGN5 583 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TRIP11Q15643 1979 aa24.44■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GALTP07902 379 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 AFMP43652 599 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SCNN1GP51170 649 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 BCAR1P56945 870 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 AMPD3Q01432 767 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 KCNA1Q09470 495 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 COASYQ13057 564 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 CUL4BQ13620 913 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB33Q86T24 672 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 FSIP1Q8NA03 581 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 HPS3Q969F9 1004 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 AAASQ9NRG9 546 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.43■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 PTGESO14684 152 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 FGF18O76093 207 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 RECQL4O94761 1208 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MCF2P10911 925 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SYKP43405 635 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MCL1Q07820 350 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 DSC1Q08554 894 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYF2-201ENST00000236273 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms