RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228437.9

PRDM4-201, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PRDM4, Length 4,210 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-201ENST00000228437 DUPD1Q68J44 220 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 STK32AQ8WU08 396 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 GINM1Q9NU53 330 aa15.51■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 C5orf60A6NFR6 353 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TTLL1O95922 423 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CACNA2D1P54289 1103 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CLUL1Q15846 466 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PRELID2Q8N945 189 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 GAS7O60861 476 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TRAF1Q13077 416 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PDIA5Q14554 519 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SNF8Q96H20 258 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SORBS3O60504 671 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ECHS1P30084 290 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 USP4Q13107 963 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PSMD6Q15008 389 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CCDC125Q86Z20 511 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.5■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PGM1P36871 562 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ARFIP2P53365 341 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PPP2R5CQ13362 524 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 BLMHQ13867 455 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TLCD1Q96CP7 247 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 EBF2Q9HAK2 575 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PEX5P50542 639 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 C1orf146Q5VVC0 180 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 UCMAQ8WVF2 138 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLC5A5Q92911 643 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 NGLY1Q96IV0 654 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 STK33Q9BYT3 514 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PARVGQ9HBI0 331 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PIK3C2AO00443 1686 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 UNC5CO95185 931 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 AKR1B1P15121 316 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 MXI1P50539 228 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 BFSP1Q12934 665 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 MAP7Q14244 749 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SPATA24Q86W54 205 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TEX9Q8N6V9 391 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.49■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 I3L4J1 428 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ATP5HO75947 161 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 KRT36O76013 467 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLURP2P0DP57 97 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SIK1P57059 783 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 GPS1Q13098 491 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 P3H1Q32P28 736 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 CACNB3P54284 484 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 BTKQ06187 659 aa15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PRDM4-201ENST00000228437 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms