RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 INTUQ9ULD6 942 aa25.91■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 USP8P40818 1118 aa25.9■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMC2Q13753 1193 aa25.9■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5C1BQ96P26 610 aa25.9■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.9■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB20Q9NX57 234 aa25.9■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 NENFQ9UMX5 172 aa25.9■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.89■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 SV2AQ7L0J3 742 aa25.89■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.89■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
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RPUSD1-201ENST00000007264 MMS19Q96T76 1030 aa25.89■■□□□ 1.74
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.89■■□□□ 1.74
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RPUSD1-201ENST00000007264 DPP9Q86TI2 863 aa25.89■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.89■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 OSBPL9Q96SU4 736 aa25.89■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.89■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 HBP1O60381 514 aa25.88■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.88■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.88■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.88■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.88■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.87■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 TNNI1P19237 187 aa25.87■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 AGPAT1Q99943 283 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 NCK2O43639 380 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ZPBP2Q6X784 338 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR142Q7Z601 462 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF149Q8NC42 400 aa25.87■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 SYT11Q9BT88 431 aa25.87■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.86■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.86■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 PSMB7Q99436 277 aa25.86■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.86■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 FTCDO95954 541 aa25.86■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 GALCP54803 685 aa25.86■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.86■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 CLDN3O15551 220 aa25.85■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 TFDP1Q14186 410 aa25.85■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.85■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.85■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 TCHPQ9BT92 498 aa25.85■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.85■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 CLDN10P78369 228 aa25.84■■□□□ 1.73
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RPUSD1-201ENST00000007264 CREG2Q8IUH2 290 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 METTL13Q8N6R0 699 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 COG1Q8WTW3 980 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 EDN1P05305 212 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 HELQQ8TDG4 1101 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 SHC3Q92529 594 aa25.84■■□□□ 1.73
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM81BQ96LP2 452 aa25.84■■□□□ 1.73
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