RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces1fQ91WU0 561 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2c50Q91X77 490 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mageb16Q9CWV4 363 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asah2Q9JHE3 756 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 JmyQ9QXM1 983 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prmt2Q9R144 448 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnnc2P20801 160 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mfsd14aP70187 490 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ano9P86044 747 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mpzl3Q3V3F6 237 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q5XFZ0 217 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc45Q8CIM1 670 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 AdigQ8R400 80 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sppl3Q9CUS9 384 aa12.7□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kpna6O35345 536 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gna15P30678 374 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd86P42082 309 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arf4P61750 180 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Palb2Q3U0P1 1104 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem232Q5K6N0 675 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgd5Q80UZ0 1219 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elf2Q9JHC9 593 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fut2Q9JL27 347 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 StrnO55106 780 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 MsnP26041 577 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccr5P51682 354 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnj4P52189 445 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt86P97861 486 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb8osQ505B7 168 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf139Q7TMV1 668 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bola2Q8BGS2 86 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 F13a1Q8BH61 732 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ca9Q8VHB5 437 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmd6Q99JI4 389 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim10Q9WUH5 489 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 EmbP21995 330 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifnar1P33896 590 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tap2P36371 702 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr2fP61219 127 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g4cQ64GA5 597 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Git1Q68FF6 770 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam160b1Q8CDM8 764 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kat5Q8CHK4 513 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtmr14Q8VEL2 648 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf34Q99KR6 376 aa12.69□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 CiitaP79621 1155 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas2r134Q7TQB0 298 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk15Q80Y86 549 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfml3Q8BK62 406 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9a9Q8BZ00 644 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 MtrrQ8C1A3 696 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kct2Q8K201 259 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Robo3Q9Z2I4 1366 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr456B2RT27 312 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9857F7CXR1 130 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp15O54732 657 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 IapP03975 557 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srebf2Q3U1N2 1130 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abi3bpQ59IW6 1179 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem260Q8BMD6 703 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Otud6bQ8K2H2 294 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr458Q8VF80 313 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr457Q8VGP5 313 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf394Q9Z1D9 521 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trip11E9Q512 1976 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col4a3Q9QZS0 1669 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alkbh1P0CB42 389 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xrcc6P23475 608 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp9bP98195 1146 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phka2Q8BWJ3 1235 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hgh1Q8C3I8 393 aa12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col24a1Q30D77 1733 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glud1P26443 558 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5935Q497S0 212 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dsg1aQ61495 1057 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 NntQ61941 1086 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 NcaphQ8C156 731 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amer2Q8CCJ4 672 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamtor4Q8CF66 99 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tlr2Q9QUN7 784 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45 ms