RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	WTM2	Q12206	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YOP1	Q12402	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YGR017W	P53210	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	BUD17	P53727	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	NAT4	Q04751	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ATG41	Q12048	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PPH21	P23594	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YSC83	P32792	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YKL075C	P36083	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NEO1	P40527	1151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	OST3	P48439	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	GPG1	P53130	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	EOS1	P53938	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SPP2	Q02521	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	MET31	Q03081	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	EKI1	Q03764	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RAS1	P01119	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	HMX1	P32339	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PPG1	P32838	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PCL7	P40186	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	MPM1	P40364	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YIL165C	P40446	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ZIM17	P42844	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SOL1	P50278	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PEX31	P53203	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YGR126W	P53274	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	TRS31	Q03337	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	TPO4	Q12256	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	FLO1	P32768	1537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CAN1	P04817	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PUT4	P15380	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NET1	P47035	1189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	COS10	P52924	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NRK1	P53915	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ATG10	Q07879	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RGT1	YKL038W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SAL1	D6W196	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	AFG1	P32317	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YPT53	P36019	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RIB1	P38066	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NTA1	P40354	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SPC19	Q03954	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	MFG1	Q07684	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	MCA1	Q08601	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SGA1	P08019	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ATP5	P09457	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	UNG1	P12887	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	BOS1	P25385	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	IMG1	P25626	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	OAC1	P32332	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CLB6	P32943	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	JHD1	P40034	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ULI1	P43604	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ZAP1	P47043	880 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	GCV1	P48015	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SHY1	P53266	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CRF1	Q04930	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	HOS1	Q12214	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ISA2	Q12425	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CYT1	P07143	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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