RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBED6P86452 979 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNH2Q12809 1159 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP7D2Q96T17 732 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNF1Q9H3M0 494 aa18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.29■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa18.29■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKAP3O75969 853 aa18.28■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 ENPEPQ07075 957 aa18.28■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TLK2Q86UE8 772 aa18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM161BQ96MY7 647 aa18.28■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.27■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL13Q8N6R0 699 aa18.27■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.27■□□□□ 0.52
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZPBP2Q6X784 338 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM50Q86XT4 487 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 KSR1Q8IVT5 923 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.26■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIGRP01833 764 aa18.25■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPD1LQ8N335 351 aa18.25■□□□□ 0.51
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CEP89Q96ST8 783 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMX1Q9H3N1 280 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CEP72Q9P209 647 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCM3APO60318 1980 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 NRCAMQ92823 1304 aa18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC26A0AVF1 554 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF233A6NK53 670 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC172P0C7W6 258 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 RFX1P22670 979 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLRC1P26715 233 aa18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CST5P28325 142 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGBP1P78318 339 aa18.24■□□□□ 0.51
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