RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 TRAPPC10P48553 1259 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 CYP4A11Q02928 519 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ZBTB33Q86T24 672 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TPH2Q8IWU9 490 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TCP11Q8WWU5 503 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 KIF3AQ9Y496 699 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.3□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 GRM6O15303 877 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 NCK2O43639 380 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 MCM7P33993 719 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 GRM5P41594 1212 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 MCM2P49736 904 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 GATMP50440 423 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 COL19A1Q14993 1142 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 XKR9Q5GH70 373 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 NLRP4Q96MN2 994 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.29□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ZBTB39O15060 712 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ITGB1P05556 798 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 FGFR1P11362 822 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 SKIP12755 728 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ATP2B1P20020 1258 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 FGFR4P22455 802 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 KCNQ1P51787 676 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 UBE3AQ05086 875 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 POU5F1BQ06416 359 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 EMC2Q15006 297 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 KSR1Q8IVT5 923 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ITPKCQ96DU7 683 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 CASD1Q96PB1 797 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 RNF19AQ9NV58 838 aa11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF623O75123 536 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 OR52Z1P0C646 297 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 LAG3P18627 525 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 MUTP22033 750 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 PHKA2P46019 1235 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 RARRES1P49788 294 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 RAB27AP51159 221 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 PTK2Q05397 1052 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 CAMK1Q14012 370 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF174Q15697 407 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 TTC38Q5R3I4 469 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 FERMT3Q86UX7 667 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 ABI1Q8IZP0 508 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM143Q96AN5 459 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 TMX3Q96JJ7 454 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 CWH43Q9H720 699 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 CARNS1A5YM72 827 aa11.26□□□□□ -0.61
UBXN8-208ENST00000616306 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms