RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18	2e-6	■■■■□ 21.8
SMTN-222	ENST00000612341	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	MYH11	P35749	1972 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	CCNE2	O96020	404 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	MME	P08473	750 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	ANXA13	P27216	316 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	UBE4B	O95155	1302 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	TMOD1	P28289	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	LIG3	P49916	1009 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	DR1	Q01658	176 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	NFIL3	Q16649	462 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	MREG	Q8N565	214 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	LSP1	P33241	339 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	PGM5	Q15124	567 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SMTN-222	ENST00000612341	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KRT5	P13647	590 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	COMT	P21964	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SCP2	P22307	547 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	ADSS	P30520	456 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KIF22	Q14807	665 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341		E7EVH7	732 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SPOP	O43791	374 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	NCAN	O14594	1321 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	MYO1F	O00160	1098 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	VCAM1	P19320	739 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	MUT	P22033	750 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	CNGA1	P29973	690 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	GPC5	P78333	572 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	BICD1	Q96G01	975 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	FMO2	Q99518	471 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	COL4A5	P29400	1685 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	NPTX2	P47972	431 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KCNJ1	P48048	391 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SKOR1	P84550	965 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	TBC1D12	O60347	775 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	CORO7	P57737	925 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	PSMC5	P62195	406 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	ANO5	Q75V66	913 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SMTN-222	ENST00000612341	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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