RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CREG2Q8IUH2 290 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT78Q8N1N4 520 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 DEPTORQ8TB45 409 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TP53INP1Q96A56 240 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RAX2Q96IS3 184 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 DBNDD2Q9BQY9 259 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CRB3Q9BUF7 120 aa4.98□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 POFUT1Q9H488 388 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF69Q9UC07 566 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.98□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ACEP12821 1306 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF16BQ96L93 1317 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NWD1Q149M9 1564 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC27A2O14975 620 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXP2O15409 715 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR1BP28222 390 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PEX2P28328 305 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 GJA4P35212 333 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 IL13P35225 146 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PIK3CBP42338 1070 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 EPHA5P54756 1037 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 EGR3Q06889 387 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TUSC3Q13454 348 aa4.97□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.97□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.97□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 TSPEARQ8WU66 669 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF5Q96JK2 942 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.97□□□□□ -1.61
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CAPNS1-210ENST00000590211 SSH2Q76I76 1423 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGEF10O15013 1369 aa4.96□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC26A4O43511 780 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 DTNBO60941 627 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TADA3O75528 432 aa4.96□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A1P53985 500 aa4.96□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 BIRC3Q13489 604 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 EMC4Q5J8M3 183 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 STEAP3Q658P3 488 aa4.96□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf31Q8N865 590 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NETO1Q8TDF5 533 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAML3Q96JK9 1138 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL10Q9BUA6 226 aa4.96□□□□□ -1.62
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