RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP2C9P11712 490 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CASP14P31944 242 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNA10Q16322 511 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SLFN12LQ6IEE8 588 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R16BQ96T49 567 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0B4J269 797 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ASGR1P07306 291 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ADKP55263 362 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CCZ1BP86790 482 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM187BQ17R55 369 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF410Q86VK4 478 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZSCAN30Q86W11 494 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GPD1LQ8N335 351 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHO2Q8TD55 490 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MFAP3LO75121 409 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 C1QTNF8P60827 252 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 AMHR2Q16671 573 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FIGNQ5HY92 759 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CPLX3Q8WVH0 158 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ABLIM1O14639 778 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TOM1L1O75674 476 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM49P0CI25 452 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM49CP0CI26 452 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GNAT1P11488 350 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT13P13646 458 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf220Q5T0J3 134 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 LHX8Q68G74 356 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MFSD14AQ96MC6 490 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC26A0AVF1 554 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 EXTL3O43909 919 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PROZP22891 400 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 VAMP7P51809 220 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DLG4P78352 724 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP7Q8WX94 980 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NUP58Q9BVL2 599 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TMX1Q9H3N1 280 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FRMPD3Q5JV73 1810 aa28.36■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 B4GALT5O43286 388 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR32O75388 356 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CNGA4Q8IV77 575 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1586Q9HCI6 787 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CAPN11Q9UMQ6 739 aa28.35■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 EPHB6O15197 1021 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FMO5P49326 533 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC42EP1Q00587 391 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KIZQ2M2Z5 673 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF180Q86T96 592 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MSTO1Q9BUK6 570 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MMRN2Q9H8L6 949 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CLDN3O15551 220 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM189A1O60320 539 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TPM1P09493 284 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP24A1Q07973 514 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM139Q8IV31 216 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 IQCDQ96DY2 449 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PANX2Q96RD6 677 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PYCARDQ9ULZ3 195 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GRIN2DO15399 1336 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ENPEPQ07075 957 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MCL1Q07820 350 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CBWD6Q4V339 395 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CBWD3Q5JTY5 395 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ATF7IP2Q5U623 682 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SESTD1Q86VW0 696 aa28.33■■■□□ 2.13
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