RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	FGFR1	P11362	822 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	UBXN11	Q5T124	520 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ABI1	Q8IZP0	508 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	LPP	Q93052	612 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HPS3	Q969F9	1004 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	RAD9A	Q99638	391 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	EXOC1	Q9NV70	894 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TBX20	Q9UMR3	447 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	INSL6	Q9Y581	213 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GUA9	196 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	CA3	P07451	260 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ABCD1	P33897	745 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	GATM	P50440	423 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TIFA	Q96CG3	184 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	PGBD4	Q96DM1	585 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	FIZ1	Q96SL8	496 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TCHP	Q9BT92	498 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		27.37	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	MYL1	P05976	194 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	MYB	P10242	640 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	SCP2	P22307	547 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	LIG4	P49917	911 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	POSTN	Q15063	836 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB33	Q86T24	672 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HACE1	Q8IYU2	909 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	IPP	Q9Y573	584 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	CIT	O14578	2027 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	LCHN	A4D1U4	455 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HOXA2	O43364	376 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	DGKI	O75912	1065 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	EOMES	O95936	686 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ITGA4	P13612	1032 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	FAM189B	P81408	668 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HES2	Q9Y543	173 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	TRIP11	Q15643	1979 aa		27.35	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	COL4A6	Q14031	1691 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	CASP5	P51878	434 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2B	Q00403	316 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	PNOC	Q13519	176 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	HVCN1	Q96D96	273 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ALCAM	Q13740	583 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ACCS	Q96QU6	501 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	PARP2	Q9UGN5	583 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		27.33	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	DPYD	Q12882	1025 aa		27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	FIBCD1	Q8N539	461 aa		27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	TIGD1	Q96MW7	591 aa		27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	RSAD1	Q9HA92	442 aa		27.32	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	KLRC4	O43908	158 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF623	O75123	536 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GPS1-223	ENST00000584229	TOM1L1	O75674	476 aa		27.31	■■□□□ 1.96

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