RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 RDH13Q8NBN7 331 aa25.54■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXL18Q96ME1 805 aa25.54■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 DEFB118Q96PH6 123 aa25.54■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOM1L1O75674 476 aa25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMC6Q7Z403 805 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERINC5Q86VE9 423 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 SAAL1Q96ER3 474 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHF24Q9UPV7 400 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 GINS2Q9Y248 185 aa25.52■■□□□ 1.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0B4J269 797 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PQY0 241 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 KBTBD13C9JR72 458 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLDN3O15551 220 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 AMHR2Q16671 573 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPD1LQ8N335 351 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNM1LO00429 736 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 B4GALT5O43286 388 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTGISQ16647 500 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC35C1Q96A29 364 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.51■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1W2PQC6 194 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PROZP22891 400 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNH2Q12809 1159 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 BFSP1Q12934 665 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSMRQ99650 979 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCHPQ9BT92 498 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.5■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 EXTL3O43909 919 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPAINQ86UA6 219 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 RSPH3Q86UC2 560 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABLIM1O14639 778 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT13P13646 458 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCL1Q07820 350 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.49■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERLIN2O94905 339 aa25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADRB2P07550 413 aa25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 WNT8BQ93098 351 aa25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF333Q96JL9 665 aa25.48■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF233A6NK53 670 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSPAN1O60635 241 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 VAMP7P51809 220 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX17Q15036 470 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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