RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579294.5

FLII-222, Transcript of FLII, actin remodeling protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FLII, Length 3,936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FLII-222	ENST00000579294	NAB2	Q15742	525 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	PCNT	O95613	3336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	ZNF263	O14978	683 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	DYNLT1	P63172	113 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FLII-222	ENST00000579294	GAS8	O95995	478 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	KCNJ1	P48048	391 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	VGLL4	Q14135	290 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	MEA1	Q16626	185 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TLR10	Q9BXR5	811 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	IRF6	O14896	467 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	GLI1	P08151	1106 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55	2e-6	■■■■□ 22.3
FLII-222	ENST00000579294	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SLITRK3	O94933	977 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CCND2	P30279	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SNCB	Q16143	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CCL15	Q16663	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TCP11	Q8WWU5	503 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ARL8A	Q96BM9	186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	GML	Q99445	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ZNF233	A6NK53	670 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	EHD4	Q9H223	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CHUK	O15111	745 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	DES	P17661	470 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	KRT15	P19012	456 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	PSMC5	P62195	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	GPC5	P78333	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	NID2	Q14112	1375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CYP2C8	P10632	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ITGA4	P13612	1032 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	TULP2	O00295	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	PSAP	P07602	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	NR3C2	P08235	984 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FLII-222	ENST00000579294	CNGA1	P29973	690 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms