RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPRED2Q7Z698 418 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM161BQ96MY7 647 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF19AQ9NV58 838 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 H0YCG3 227 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 N4BP3O15049 544 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAP1Q03518 808 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 Q7L0L9 218 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF576Q9H609 170 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 HES2Q9Y543 173 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 IPPQ9Y573 584 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 LINC01553A4QN01 128 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR153Q6NV75 609 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 COASYQ13057 564 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNNM3Q8NE01 707 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HELQQ8TDG4 1101 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HPS3Q969F9 1004 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF39Q9H2S5 420 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CERS4Q9HA82 394 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX20Q9UMR3 447 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDH23Q9H251 3354 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO9BQ13459 2157 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGMOQ6ZNB7 445 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 FIBCD1Q8N539 461 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGBD4Q96DM1 585 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASD1Q96PB1 797 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 APOL6Q9BWW8 343 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXA2O43364 376 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2BQ00403 316 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABI1Q8IZP0 508 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEFB123Q8N688 67 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENGASEQ8NFI3 743 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNN1Q92952 543 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADPGKQ9BRR6 497 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM117Q9H0C3 514 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 OLFML3Q9NRN5 406 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCNT3O95395 438 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITGA4P13612 1032 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASP5P51878 434 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC13DQ70J99 1090 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB33Q86T24 672 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 BICD1Q96G01 975 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRR29P0C7W0 189 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYBP10242 640 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCP2P22307 547 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKAP5P24588 427 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCHPQ9BT92 498 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRA6Q9BX79 667 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 HCSTQ9UBK5 93 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R37O75864 691 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRIN2CQ14957 1233 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZPBP2Q6X784 338 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms