RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 RPS6KA5O75582 802 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 MYL5Q02045 173 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 ZPBP2Q6X784 338 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 FAM228AQ86W67 206 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 RNF214Q8ND24 703 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 HIPK3Q9H422 1215 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 BECN2A8MW95 431 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 IKBKBO14920 756 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TSPAN1O60635 241 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 SPATA1Q5VX52 437 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 LUZP1Q86V48 1076 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TBX21Q9UL17 535 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 SQORQ9Y6N5 450 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 LTBP2Q14767 1821 aa20.97■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 GHRP10912 638 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 LPIN1Q14693 890 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 NCAPHQ15003 741 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 CPB2Q96IY4 423 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.96■□□□□ 0.95
CTU2-204ENST00000564105 TOM1L1O75674 476 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 NR3C1P04150 777 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 NR2F2P24468 414 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 MBTPS1Q14703 1052 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 NFIL3Q16649 462 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 USP38Q8NB14 1042 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 RBSNQ9H1K0 784 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.95■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 GPR182O15218 404 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 GARTP22102 1010 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 ADSSP30520 456 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 AXLP30530 894 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PAK2Q13177 524 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 ADAM9Q13443 819 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 TCHPQ9BT92 498 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PADI3Q9ULW8 664 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.94■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CLDN3O15551 220 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PROZP22891 400 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CD52P31358 61 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CYP2C18P33260 490 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CYP2J2P51589 502 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 TTC3P53804 2025 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 A0A1B0GUA9 196 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 N4BP3O15049 544 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 CETN3O15182 167 aa20.93■□□□□ 0.94
CTU2-204ENST00000564105 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms