RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.41■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AAASQ9NRG9 546 aa24.41■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO9BQ13459 2157 aa24.41■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 H3BNC9 293 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LPXNO60711 386 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPTXRO95502 500 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGA4P13612 1032 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYCT1Q8N699 235 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQUBQ8NA54 791 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX12PQ92771 950 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DHX58Q96C10 678 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNMDQ9H2S6 317 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.4■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCHHQ07283 1943 aa24.39■■□□□ 1.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYMKA6NI61 221 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAG3P18627 525 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGFBP4P22692 258 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STRN3Q13033 797 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPM6BQ13491 265 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LONRF3Q496Y0 759 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADALQ6DHV7 355 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DYMQ7RTS9 669 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 P2RX5Q93086 422 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CWH43Q9H720 699 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.39■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAK2O60296 914 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OFD1O75665 1012 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCD1P33897 745 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 URGCPQ8TCY9 931 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HCSTQ9UBK5 93 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP20Q9Y2K6 914 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.38■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 K7ENM7 598 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HES2Q9Y543 173 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.37■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARNS1A5YM72 827 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INPPL1O15357 1258 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAP43P17677 238 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CMA1P23946 247 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMPD3Q01432 767 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APOL6Q9BWW8 343 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.36■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPROQ16827 1216 aa24.35■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZPBP2Q6X784 338 aa24.35■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SFR1Q86XK3 245 aa24.35■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF558Q96NG5 402 aa24.35■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FIZ1Q96SL8 496 aa24.35■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF39Q9H2S5 420 aa24.35■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPM1AP35813 382 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MLH1P40692 756 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAD1Q99259 594 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.34■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms