RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 RHPN2Q8IUC4 686 aa19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 KAT2BQ92831 832 aa19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIX2Q9NPC8 291 aa19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 STYXL1Q9Y6J8 313 aa19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 THSD7BQ9C0I4 1608 aa19.39■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDN1P05305 212 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXD10P28358 340 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TFDP1Q14186 410 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf220Q5T0J3 134 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF149Q8NC42 400 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXL18Q96ME1 805 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 C2orf40Q9H1Z8 148 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRRDQ9UH36 339 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.39■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRN3P2A6NIE6 340 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAS3O00219 553 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 UCHL3P15374 230 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCLMP48507 274 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 HTRA3P83110 453 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK17Q00537 523 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 POU5F1BQ06416 359 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP3CAQ08209 521 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJB7Q6PEY0 223 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPD1LQ8N335 351 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD99L2Q8TCZ2 262 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC127Q96BQ5 260 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 LZTFL1Q9NQ48 299 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa19.38■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR25O00155 361 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEPT4O43236 478 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMOD1P28289 359 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJA9P57773 515 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAPGEF1Q13905 1077 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM65Q6PJ69 517 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYT10Q6XYQ8 523 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFKBIZQ9BYH8 718 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRCAMQ92823 1304 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSCO60682 206 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNRH1P01148 92 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX3-2P78367 333 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 BEX3Q00994 111 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFSD10Q14728 455 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC42Q96M95 316 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP4Q96MN2 994 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAPLN2Q9GZV7 340 aa19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP4BP1P59074 171 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTENP60484 403 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID5AQ03989 594 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP24A1Q07973 514 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM32Q13049 653 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLFN12LQ6IEE8 588 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZPBP2Q6X784 338 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC170Q8IYT3 715 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFSD14AQ96MC6 490 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 KATNAL1Q9BW62 490 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SETD4Q9NVD3 440 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 KPNA6O60684 536 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYL3P08590 195 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSEN2P49810 448 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAPK6Q16659 721 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 HGSNATQ68CP4 663 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQCEQ6IPM2 695 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 EHBP1Q8NDI1 1231 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARD3BQ8TEW8 1205 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPAG5Q96R06 1193 aa19.35■□□□□ 0.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEF6Q9H4E7 631 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms