RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 AASSQ9UDR5 926 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DACH1Q9UI36 760 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 GGA2Q9UJY4 613 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 WDR64B1ANS9 1081 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 AGPSO00116 658 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DTNBO60941 627 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 KCNA2P16389 499 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ATP5JP18859 108 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MCM3P25205 808 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SEPHS1P49903 392 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DSG1Q02413 1049 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DDB1Q16531 1140 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ME3Q16798 604 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 FUKQ8N0W3 1084 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TBC1D5Q92609 795 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MST1RQ04912 1400 aa7.32□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 C9IYK1 514 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TRIM38O00635 465 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 STX10O60499 249 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ALDH2P05091 517 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CTAGE8P0CG41 777 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ARSDP51689 593 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TNFAIP2Q03169 654 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SEMA5AQ13591 1074 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC32Q14392 662 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 KRT32Q14532 448 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 KRT72Q14CN4 511 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CCNJLQ8IV13 435 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TM9SF2Q99805 663 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ACAD9Q9H845 621 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 RASSF1Q9NS23 344 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 PDP2Q9P2J9 529 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CFAP45Q9UL16 551 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 BIN1O00499 593 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 PFKFB2O60825 505 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 TGDSO95455 350 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 NR3C2P08235 984 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 FGFR1P11362 822 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 HSD3B1P14060 373 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SELPP16109 830 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MUTP22033 750 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ATP6V1E1P36543 226 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 GRM5P41594 1212 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC7A5Q01650 507 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MAP7Q14244 749 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 NCAPHQ15003 741 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MEA1Q16626 185 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CFAP58Q5T655 872 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DEPTORQ8TB45 409 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 STAP2Q9UGK3 403 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MAFFQ9ULX9 164 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN3-209ENST00000560715 MAP3K5Q99683 1374 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms