RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 GABRDO14764 452 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 KPNA6O60684 536 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ABLIM3O94929 683 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CRTAMO95727 393 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 F2P00734 622 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MYL1P05976 194 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CDK4P11802 303 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 VPS72Q15906 364 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SYNE4Q8N205 404 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CNTD1Q8N815 330 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 WDR48Q8TAF3 677 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 HOOK2Q96ED9 719 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 C2orf78A6NCI8 922 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CBX4O00257 560 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MMEP08473 750 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 PYGMP11217 842 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SDHAP31040 664 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 C14orf80Q86SX3 495 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MTMR8Q96EF0 704 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TNKSO95271 1327 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 RASSF10A6NK89 507 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ATF3P18847 181 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 KRT85P78386 507 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 GUCY1A3Q02108 690 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 DSG1Q02413 1049 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MAP3K12Q12852 859 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 INAVAQ3KP66 663 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 LONRF3Q496Y0 759 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MFSD5Q6N075 450 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 UBE2QL1A1L167 161 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 PROB1E7EW31 1015 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA0355O15063 1070 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 FKBP9O95302 570 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 LSSP48449 732 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TMPRSS15P98073 1019 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 OCRLQ01968 901 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SART3Q15020 963 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ACAP1Q15027 740 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 MLC1Q15049 377 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CRY1Q16526 586 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CALML6Q8TD86 181 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 DLG3Q92796 817 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 C16orf92Q96LL3 132 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TCF25Q9BQ70 676 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 IL23AQ9NPF7 189 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 GSTA4O15217 222 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF185O15231 689 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ULK1O75385 1050 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 TYRP1P17643 537 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ID4P47928 161 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 BPIFB4P59827 614 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 Q6YL49 198 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 DGKHQ86XP1 1220 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SVIPQ8NHG7 77 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms