RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 TRIM29Q14134 588 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PTPN14Q15678 1187 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CALCRLQ16602 461 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 UBXN11Q5T124 520 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 KANK3Q6NY19 840 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NOTUMQ6P988 496 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 HACE1Q8IYU2 909 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PRSS33Q8NF86 280 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CCDC51Q96ER9 411 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CSRNP2Q9H175 543 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CDH22Q9UJ99 828 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TRIOO75962 3097 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TECTAO75443 2155 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ARL5CA6NH57 179 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 BTBD18B2RXH4 712 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 B4GALT3O60512 393 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 DTNBO60941 627 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 LILRB3O75022 631 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 URODP06132 367 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PRR29P0C7W0 189 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 OR1G1P47890 313 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CLCN4P51793 760 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 GPR149Q86SP6 731 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NECAB1Q8N987 351 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TNFRSF25Q93038 417 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 GAD1Q99259 594 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 IPPQ9Y573 584 aa9.07□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 FAM205CA6NFA0 338 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 C2CD2LO14523 706 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NEMFO60524 1076 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TSPAN1O60635 241 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 BRD1O95696 1058 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SOD2P04179 222 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ASGR2P07307 311 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ADH1AP07327 375 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ARL2P36404 184 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 RARRES1P49788 294 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NEK4P51957 841 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TCF15Q12870 199 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 GSE1Q14687 1217 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ME3Q16798 604 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CPB2Q96IY4 423 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.06□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 A0A087WWV3 80 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GUA9 196 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 INPPL1O15357 1258 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 C1RP00736 705 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ATP2B1P20020 1258 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 MLH1P40692 756 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 GLUD2P49448 558 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SCNN1GP51170 649 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 DSC1Q08554 894 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TDGQ13569 410 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CAPSQ13938 189 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.05□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms