RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	STBD1	O95210	358 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CTDNEP1	O95476	244 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CFH	P08603	1231 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LAMP2	P13473	410 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AXL	P30530	894 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GLUD2	P49448	558 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PLXNA3	P51805	1871 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NLRP5	P59047	1200 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DSG1	Q02413	1049 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CREM	Q03060	361 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NID2	Q14112	1375 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LONRF3	Q496Y0	759 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GALNT17	Q6IS24	598 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ANO5	Q75V66	913 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TBCK	Q8TEA7	893 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TCP11	Q8WWU5	503 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RUBCN	Q92622	972 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GTF3C6	Q969F1	213 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ANHX	E9PGG2	379 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	C2CD2L	O14523	706 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EDIL3	O43854	480 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EFEMP2	O95967	443 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	POMC	P01189	267 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ITGA4	P13612	1032 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	IFNAR1	P17181	557 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SDHB	P21912	280 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RFC5	P40937	340 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EVC	P57679	992 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GUCY1B3	Q02153	619 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NTRK3	Q16288	839 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KSR1	Q8IVT5	923 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HACE1	Q8IYU2	909 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RMDN1	Q96DB5	314 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CCDC51	Q96ER9	411 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MBOAT7	Q96N66	472 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CHST7	Q9NS84	486 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TMEM150B	A6NC51	233 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	B4GALT3	O60512	393 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ERLIN2	O94905	339 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SP9	P0CG40	484 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	OR1G1	P47890	313 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	STARD6	P59095	220 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	POU5F1B	Q06416	359 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DSC1	Q08554	894 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PPP2R5C	Q13362	524 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	USP41	Q3LFD5	358 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	UBXN11	Q5T124	520 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NOTUM	Q6P988	496 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	C4orf19	Q8IY42	314 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GPR152	Q8TDT2	470 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CEP170P1	Q96L14	293 aa		7.63	□□□□□ -1.19

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