RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GABRD	O14764	452 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF623	O75123	536 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM127	O75204	238 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	SLC5A3	P53794	718 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	UBE3C	Q15386	1083 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ADRM1	Q16186	407 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	FZD9	O00144	591 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	RBP3	P10745	1247 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	AGXT	P21549	392 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	CTSS	P25774	331 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ITK	Q08881	620 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GRM7	Q14831	915 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	TOR2A	Q5JU69	321 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	EDA	Q92838	391 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	IL23A	Q9NPF7	189 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ING3	Q9NXR8	418 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310		A0A1W2PRX2	142 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	PHF2	O75151	1096 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	KATNA1	O75449	491 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GAST	P01350	101 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	COMT	P21964	271 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	EVA1C	P58658	441 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310		Q6ZSN1	163 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	OR14A2	Q96R54	314 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	DEF6	Q9H4E7	631 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GREM2	Q9H772	168 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	SHTN1	A0MZ66	631 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	UBE2QL1	A1L167	161 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GYPE	P15421	78 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ANAPC15	P60006	121 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	KRTAP10-9	P60411	292 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	IGBP1	P78318	339 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	FOXL1	Q12952	345 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	MALL	Q13021	153 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ACAP1	Q15027	740 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	HS1BP3	Q53T59	392 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	KRT40	Q6A162	431 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	PALM2	Q8IXS6	379 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	GPR156	Q8NFN8	814 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	TCF25	Q9BQ70	676 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LGR5-204	ENST00000547310	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	LMO1	P25800	156 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	WAS	P42768	502 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	MCAM	P43121	646 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	SELENOP	P49908	381 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	NPEPPS	P55786	919 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	CDK17	Q00537	523 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	MFSD5	Q6N075	450 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	VOPP1	Q96AW1	172 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	MTMR8	Q96EF0	704 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	MUSK	O15146	869 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	CRHR1	P34998	444 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	DUSP2	Q05923	314 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LGR5-204	ENST00000547310	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45

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