RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 CENPPQ6IPU0 288 aa28.15■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 SCLYQ96I15 445 aa28.15■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.15■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 NBNO60934 754 aa28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 DPCR1Q3MIW9 517 aa28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 P2RX5Q93086 422 aa28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 KCTD10Q9H3F6 313 aa28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
STIP1-208ENST00000540501 GARTP22102 1010 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 FGFR4P22455 802 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 HOXD13P35453 343 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 KCNA1Q09470 495 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 MYBPC2Q14324 1141 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 NFIL3Q16649 462 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TMEM174Q8WUU8 243 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 STYXL1Q9Y6J8 313 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 SCN5AQ14524 2016 aa28.13■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 CLDN3O15551 220 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 CD44P16070 742 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 RPL13P26373 211 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ZNF445P59923 1031 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 EDRF1Q3B7T1 1238 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 KLHL10Q6JEL2 608 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 LRSAM1Q6UWE0 723 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 C12orf56Q8IXR9 622 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 NELFBQ8WX92 580 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TCHPQ9BT92 498 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 RWDD2AQ9UIY3 292 aa28.12■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 B4GALT5O43286 388 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TGFB1I1O43294 461 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 LDHAP00338 332 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 SKIP12755 728 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 PROZP22891 400 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 GPNMBQ14956 572 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 KYAT1Q16773 422 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ARMCX5Q6P1M9 558 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TET1Q8NFU7 2136 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TRAIPQ9BWF2 469 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.11■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 EFCAB14O75071 495 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ITGB8P26012 769 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 RAB27AP51159 221 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 SLC9A9Q8IVB4 645 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 POMGNT1Q8WZA1 660 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 CPB2Q96IY4 423 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 IL23AQ9NPF7 189 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 C1orf112Q9NSG2 853 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.1■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 MCF2P10911 925 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ACTN1P12814 892 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 FPGSQ05932 587 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 MCL1Q07820 350 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 HACE1Q8IYU2 909 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 BPIFA3Q9BQP9 254 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 PDZD7Q9H5P4 517 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 KIAA1586Q9HCI6 787 aa28.09■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD63C9JTQ0 380 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 EDN1P05305 212 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 CSF2RAP15509 400 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 DSC3Q14574 896 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ANO6Q4KMQ2 910 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.08■■■□□ 2.09
STIP1-208ENST00000540501 A0A0B4J269 797 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 IKBKEQ14164 716 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 SLC39A4Q6P5W5 647 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 BADQ92934 168 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 TSPY26PQ9H489 355 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 RGS18Q9NS28 235 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.07■■■□□ 2.08
STIP1-208ENST00000540501 LTBP2Q14767 1821 aa28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms