RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	P2RX5	Q93086	422 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PANK4	Q9NVE7	773 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	NFASC	O94856	1347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	EML1	O00423	815 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DGKI	O75912	1065 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	CLCN1	P35523	988 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	COASY	Q13057	564 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ADAM15	Q13444	863 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	POTEG	Q6S5H5	508 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SPC24	Q8NBT2	197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PRSS33	Q8NF86	280 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	GJA10	Q969M2	543 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PHOX2B	Q99453	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TSG101	Q99816	390 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PLVAP	Q9BX97	442 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MYH11	P35749	1972 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131		E9PMD0	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ENPP3	O14638	875 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SLITRK3	O94933	977 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	CSPG5	O95196	566 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TPM2	P07951	284 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	IDE	P14735	1019 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJB1	P25685	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SP4	Q02446	784 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	STK4	Q13043	487 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	NR1I3	Q14994	352 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	EDA	Q92838	391 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	UBE4B	O95155	1302 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	KCNJ18	B7U540	433 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ATP9A	O75110	1047 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	GLP2R	O95838	553 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	ITGB1	P05556	798 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	KCNA2	P16389	499 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	STX17	P56962	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM14	Q14142	442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	KCNJ12	Q14500	433 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	GRIK4	Q16099	956 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DYM	Q7RTS9	669 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	TMC6	Q7Z403	805 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	IQCD	Q96DY2	449 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MEG3-223	ENST00000524131	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms