RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 P2RX5Q93086 422 aa8.77□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.77□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 PKN1Q16512 942 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 LIN52Q52LA3 116 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 VSTM1Q6UX27 236 aa8.75□□□□□ -1.01
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CLVS1-204ENST00000518858 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC25Q86WR0 208 aa8.75□□□□□ -1.01
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