RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL14O95715 111 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC11A1P49279 550 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT79Q5XKE5 535 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HACE1Q8IYU2 909 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS52Q8N1B4 723 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B4GALT5O43286 388 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTSAP10619 480 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALADP13716 330 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAMPTP43490 491 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP2R5AQ15172 486 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GBP3Q9H0R5 595 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBP1Q9H171 429 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF39Q9H2S5 420 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNM3Q9UQ16 869 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL5CA6NH57 179 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR37L1O60883 481 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POMCP01189 267 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL17AQ16552 155 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIFAP3Q92845 792 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HES2Q9Y543 173 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACKR2O00590 384 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRP1O14786 923 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B4GALT3O60512 393 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFNA5P52803 228 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK6Q16659 721 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEPTORQ8TB45 409 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BSNDQ8WZ55 320 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUSD6Q92537 303 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASP10Q92851 521 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFT74Q96LB3 600 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAD1Q99259 594 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S1PR5Q9H228 398 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NR1I2O75469 434 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPTXRO95502 500 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLH1P40692 756 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DSC1Q08554 894 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM31Q5JXX7 168 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIOSQ9NXC5 875 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C5orf42Q9H799 3197 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 E9PMD0 336 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 N4BP3O15049 544 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUL4AQ13619 759 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP42Q96MM3 310 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PP2D1A8MPX8 630 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCXO43602 365 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKCBP05771 671 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL9A1P20849 921 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKAP5P24588 427 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC25AP30304 524 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CA8P35219 290 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR1G1P47890 313 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCNN1GP51170 649 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITIH3Q06033 890 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HYIQ5T013 277 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRFN3Q9BTN0 628 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APOL6Q9BWW8 343 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms