RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 LPAR1Q92633 364 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BORCS6Q96GS4 357 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BTBD6Q96KE9 485 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CCDC114Q96M63 670 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 THAP2Q9H0W7 228 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZNF862O60290 1169 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TMEM143Q96AN5 459 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PLAAQ9Y263 795 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 A6NNZ2 444 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CLGNO14967 610 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PRLRP16471 622 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PAK2Q13177 524 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TUBB8Q3ZCM7 444 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 POMGNT1Q8WZA1 660 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 KMT5AQ9NQR1 393 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 STK24Q9Y6E0 443 aa17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 WDR64B1ANS9 1081 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PLS3P13797 630 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CDR1P51861 262 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZNF131P52739 623 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 NEDD9Q14511 834 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MEI1Q5TIA1 1274 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SCLT1Q96NL6 688 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ACCSQ96QU6 501 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CYP26A1O43174 497 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 RAD51CO43502 376 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 NPTX2P47972 431 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MXI1P50539 228 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 E2F5Q15329 346 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 B3GNT9Q6UX72 402 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 METTL13Q8N6R0 699 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 XXYLT1Q8NBI6 393 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SLC35G2Q8TBE7 412 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 RUBCNQ92622 972 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DPH5Q9H2P9 285 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 GDF3Q9NR23 364 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 KIF4AO95239 1232 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MARK3P27448 753 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ELF1P32519 619 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 NF2P35240 595 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SMTNP53814 917 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 27.6
PFKL-211ENST00000498841 CCDC121Q6ZUS5 278 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.96■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 RASSF9O75901 435 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 SGPL1O95470 568 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 FAM107AO95990 144 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 KRT5P13647 590 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 TMOD1P28289 359 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 JAM2P57087 298 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 PSMC5P62195 406 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 ANKRD35Q8N283 1001 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 FAM213AQ9BRX8 229 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 HAUS2Q9NVX0 235 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 FERP16591 822 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 MCM8Q9UJA3 840 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 NR2E1Q9Y466 385 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa17.95■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 RGS20O76081 388 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 TNFRSF8P28908 595 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 ACOT2P49753 483 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 QPCTQ16769 361 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 KIRREL3Q8IZU9 778 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 SEMA4DQ92854 862 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.94■□□□□ 0.46
PFKL-211ENST00000498841 SEL1LQ9UBV2 794 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms