RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 GIMAP6Q6P9H5 292 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 BTNL9Q6UXG8 535 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NXPE1Q8N323 547 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 OR5M3Q8NGP4 307 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NDC1Q9BTX1 674 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 OSBPL6Q9BZF3 934 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 EPC1Q9H2F5 836 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PRDM12Q9H4Q4 367 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SYBUQ9NX95 663 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 UNC119BA6NIH7 251 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MTSS1O43312 755 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TGM5O43548 720 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NDUFA10O95299 355 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ASLP04424 464 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 APPP05067 770 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ZMYM3Q14202 1370 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MYPNQ86TC9 1320 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 C7orf31Q8N865 590 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MYEOVQ96EZ4 313 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 RSAD1Q9HA92 442 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CABP5Q9NP86 173 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 DKK2Q9UBU2 259 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 USP18Q9UMW8 372 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 B4E1Z4 1266 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 WNT10BO00744 389 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 FSBPO95073 299 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TYRP1P17643 537 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CFAP100Q494V2 611 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 JAZF1Q86VZ6 243 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NME9Q86XW9 330 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 LCORLQ8N3X6 602 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ADAM2Q99965 735 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PFKMP08237 780 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NHLH2Q02577 135 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ADCY1Q08828 1119 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 METRNLQ641Q3 311 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 FAM83AQ86UY5 434 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 RNF169Q8NCN4 708 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 IL17RAQ96F46 866 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 NEU1Q99519 415 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 HIST1H2AJQ99878 128 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MTFR1LQ9H019 292 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SPON1Q9HCB6 807 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TBX22Q9Y458 520 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 A0A1W2PR48 441 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PRSS38A1L453 326 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 KPNA6O60684 536 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 RGS19P49795 217 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 GZMKP49863 264 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SEC24CP53992 1094 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TP53BP2Q13625 1128 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 UBE3CQ15386 1083 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms