RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	CLIC2	O15247	247 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	NR2F2	P24468	414 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	MYBPC2	Q14324	1141 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	CEP63	Q96MT8	703 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	THAP9	Q9H5L6	903 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	FANCL	Q9NW38	375 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TTC19-208	ENST00000497842	CETN3	O15182	167 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ADAM9	Q13443	819 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	AMHR2	Q16671	573 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	PITPNM1	O00562	1244 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TSPAN1	O60635	241 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TOM1L1	O75674	476 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	EDN1	P05305	212 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	GART	P22102	1010 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	31.18	■■■□□ 2.58	2e-6	■■■■□ 23.2
TTC19-208	ENST00000497842	FAAP100	Q0VG06	881 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	USP38	Q8NB14	1042 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	PRO3102	Q9H379	93 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	USP20	Q9Y2K6	914 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TISP43	B9A030	160 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	B4GALT5	O43286	388 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	SELP	P16109	830 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FGFR4	P22455	802 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	AXL	P30530	894 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TCHP	Q9BT92	498 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	RPS6KA5	O75582	802 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CYP2J2	P51589	502 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	UVSSA	Q2YD98	709 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	DMAC2	Q9NW81	257 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FSD2	A1L4K1	749 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	N4BP3	O15049	544 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CLDN3	O15551	220 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ADSS	P30520	456 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FAM228A	Q86W67	206 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	GPR182	O15218	404 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	GNA14	O95837	355 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CPB2	Q96IY4	423 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	HIPK3	Q9H422	1215 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842		A0A0B4J269	797 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	EXOC3	O60645	756 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CLTB	P09497	229 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	PROZ	P22891	400 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	CEP135	Q66GS9	1140 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	NOTUM	Q6P988	496 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
TTC19-208	ENST00000497842		A0A1B0GUA9	196 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TTC19-208	ENST00000497842	GHR	P10912	638 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF18	P17022	549 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TTC19-208	ENST00000497842	SPAG1	Q07617	926 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TTC19-208	ENST00000497842	MCL1	Q07820	350 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TTC19-208	ENST00000497842	PAK2	Q13177	524 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TTC19-208	ENST00000497842	LPIN1	Q14693	890 aa		31.13	■■■□□ 2.57

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