RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 Q9Y3F1 56 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 ENO4A6NNW6 628 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 CCT5P48643 541 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 CEP170P1Q96L14 293 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 MED15Q96RN5 788 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 THAP9Q9H5L6 903 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO1FO00160 1098 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 CBFA2T2O43439 604 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 HIP1RO75146 1068 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 ATP4AP20648 1035 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 CTGFP29279 349 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 VEGFBP49765 207 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 KCNN1Q92952 543 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 HVCN1Q96D96 273 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM47Q96LD4 638 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 EPAS1Q99814 870 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 RNF186Q9NXI6 227 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 FLRT1Q9NZU1 646 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 RAB21Q9UL25 225 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 COL1A2P08123 1366 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAPO00193 183 aa7.83□□□□□ -1.16
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SMARCE1-211ENST00000493660 SMPD1P17405 629 aa7.83□□□□□ -1.16
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SMARCE1-211ENST00000493660 HOXD10P28358 340 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFAIP2Q03169 654 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.83□□□□□ -1.16
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SMARCE1-211ENST00000493660 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 DAW1Q8N136 415 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 MYCT1Q8N699 235 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.83□□□□□ -1.16
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.83□□□□□ -1.16
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