RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 FKBP9O95302 570 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ABHD16AO95870 558 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GPR15P49685 360 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GZMKP49863 264 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 FAM189BP81408 668 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 DUSP2Q05923 314 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 UBE3CQ15386 1083 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 VPS72Q15906 364 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 FAM83AQ86UY5 434 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 KCNH6Q9H252 994 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PRSS50Q9UI38 385 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 KDM1AO60341 852 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 NRP2O60462 931 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 WNT3AP56704 352 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 OCRLQ01968 901 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 CSRP2Q16527 193 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 METTL24Q5JXM2 366 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 BROXQ5VW32 411 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 DOK3Q7L591 496 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 MFSD3Q96ES6 412 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 FEZ1Q99689 392 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 NDC1Q9BTX1 674 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 EMC7Q9NPA0 242 aa6.28□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LEFTY2O00292 366 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LPXNO60711 386 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 TMEM127O75204 238 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 RECQL4O94761 1208 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 GCP02774 474 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 GYPEP15421 78 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 NRG3P56975 720 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 AHI1Q8N157 1196 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 ZMYM3Q14202 1370 aa6.27□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 BMP5P22003 454 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PTPAQ15257 358 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 DDB1Q16531 1140 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 ANKS6Q68DC2 871 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 SYT12Q8IV01 421 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PLAAQ9Y263 795 aa6.26□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 A0A087X0B3 334 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF4O60810 478 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LPLP06858 475 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 C11orf74Q86VG3 221 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 SLC5A5Q92911 643 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 TEX101Q9BY14 249 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 COL4A3Q01955 1670 aa6.25□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 RAB11FIP3O75154 756 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 NCR1O76036 304 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LAG3P18627 525 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 ADRA1BP35368 520 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 APBA1Q02410 837 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PDCD1Q15116 288 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 CT83Q5H943 113 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 SPON1Q9HCB6 807 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 EDARQ9UNE0 448 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PCSK5Q92824 1860 aa6.24□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.23□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 ITGA10O75578 1167 aa6.23□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SSB-211ENST00000490914 LGALS4P56470 323 aa6.23□□□□□ -1.41
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