RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 HOXA2O43364 376 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 GNA14O95837 355 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 PIGRP01833 764 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 AMHP03971 560 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 MYBP10242 640 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 MCF2P10911 925 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 GARTP22102 1010 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 CYP2C18P33260 490 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 EHHADHQ08426 723 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 STK4Q13043 487 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 HIC1Q14526 733 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 LPIN1Q14693 890 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 EDRF1Q3B7T1 1238 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ISM2Q6H9L7 571 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 NELFCDQ8IXH7 590 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 BSNDQ8WZ55 320 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 P2RX5Q93086 422 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 POLD4Q9HCU8 107 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 RWDD2AQ9UIY3 292 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 PADI3Q9ULW8 664 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GUA9 196 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 STX10O60499 249 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 EXOC3O60645 756 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 EOMESO95936 686 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 FGBP02675 491 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 KRT13P13646 458 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 CCNE1P24864 410 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 CD52P31358 61 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 PRCPP42785 496 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 TYRO3Q06418 890 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 SURF1Q15526 300 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 CD302Q8IX05 232 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ABI1Q8IZP0 508 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ADSSL1Q8N142 457 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 NELFBQ8WX92 580 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 RNF39Q9H2S5 420 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 TSPY26PQ9H489 355 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 IL23AQ9NPF7 189 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 GDAQ9Y2T3 454 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-210ENST00000486889 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 TSPAN1O60635 241 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R37O75864 691 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 CXCL10P02778 98 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM9Q13443 819 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 FAM228AQ86W67 206 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 SCLYQ96I15 445 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 CEP63Q96MT8 703 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM2Q99965 735 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 CTNND2Q9UQB3 1225 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF233A6NK53 670 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ZBBXA8MT70 800 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 OGTO15294 1046 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 EXTL3O43909 919 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 NR3C1P04150 777 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 CLTAP09496 248 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-210ENST00000486889 ITGA4P13612 1032 aa10.63□□□□□ -0.71
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