RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	APOL6	Q9BWW8	343 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PBX4	Q9BYU1	374 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	EXOC1	Q9NV70	894 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TBX20	Q9UMR3	447 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	INSL6	Q9Y581	213 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HOXA2	O43364	376 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	DGKI	O75912	1065 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	MYB	P10242	640 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	MYOG	P15173	224 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	LIG4	P49917	911 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	POSTN	Q15063	836 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	IPP	Q9Y573	584 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TCHH	Q07283	1943 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF623	O75123	536 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	FGFR1	P11362	822 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ITGA4	P13612	1032 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJB2	P25686	324 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	GATM	P50440	423 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	DPYD	Q12882	1025 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PNOC	Q13519	176 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ALCAM	Q13740	583 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	LPP	Q93052	612 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	KLRC4	O43908	158 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TOM1L1	O75674	476 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	CA3	P07451	260 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	CASP5	P51878	434 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PSMD2	Q13200	908 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	KCNN1	Q92952	543 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	HES2	Q9Y543	173 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	CLDN3	O15551	220 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PPP1R37	O75864	691 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SMC2	O95347	1197 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	AKAP5	P24588	427 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	CDT1	Q9H211	546 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.96	□□□□□ -0.17

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