RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ENPP3O14638 875 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 BAIAP3O94812 1187 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 IKBKEQ14164 716 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 RASIP1Q5U651 963 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 HERVK_113Q902F9 699 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TISP43B9A030 160 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 C9IYK1 514 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 BIN1O00499 593 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TOM1L1O75674 476 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 FGBP02675 491 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 PRO3102Q9H379 93 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 N4BP3O15049 544 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TGFB1I1O43294 461 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 EFCAB14O75071 495 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ACTN1P12814 892 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 FAM189BP81408 668 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ISM2Q6H9L7 571 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.092e-30■■■□□ 14.8
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 CDT1Q9H211 546 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TMEM206Q9H813 350 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 TTC3P53804 2025 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 A0A0U1RQF3 1178 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 BMP8BP34820 402 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 PRCPP42785 496 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 LIG4P49917 911 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 ADSSL1Q8N142 457 aa21.85■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 FAM189A1O60320 539 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ZNF623O75123 536 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ADSSP30520 456 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 DEFB103AP81534 67 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 MCL1Q07820 350 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 BICD1Q96G01 975 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 GBP3Q9H0R5 595 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 PTPRSQ13332 1948 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 A0A0B4J269 797 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 NPTXRO95502 500 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 RAB27AP51159 221 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 SHHQ15465 462 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.83■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTB-210ENST00000477812 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.83■■□□□ 1.09
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ACTB-210ENST00000477812 MCF2P10911 925 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 IPPQ9Y573 584 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CLDN3O15551 220 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 KIF20AO95235 890 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 NLRP12P59046 1061 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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