RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, human

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKIL-208	ENST00000477216	HIP1R	O75146	1068 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	HPSE	Q9Y251	543 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	TECTA	O75443	2155 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	MAPK7	Q13164	816 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	CAPS	Q13938	189 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	TFDP1	Q14186	410 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	ODR4	Q5SWX8	454 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	DAW1	Q8N136	415 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	RNF149	Q8NC42	400 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	CD52	P31358	61 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	PRSS33	Q8NF86	280 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	BSND	Q8WZ55	320 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	DRC1	Q96MC2	740 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SKIL-208	ENST00000477216	LINC01565	O15544	149 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	RPS6KA5	O75582	802 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	ITGB1	P05556	798 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	NDUFA8	P51970	172 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	FOXK2	Q01167	660 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CAMK1	Q14012	370 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	FAM228A	Q86W67	206 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	POF1B	Q8WVV4	589 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	REEP2	Q9BRK0	252 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	TLE6	Q9H808	572 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CLEC1B	Q9P126	229 aa		27.57	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	PHKA2	P46019	1235 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	NRIP1	P48552	1158 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	POU5F1B	Q06416	359 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	PAK2	Q13177	524 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	PPP2R5A	Q15172	486 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	IFT74	Q96LB3	600 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	PADI3	Q9ULW8	664 aa		27.56	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	C5orf42	Q9H799	3197 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	MYMK	A6NI61	221 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	SYK	P43405	635 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	NAMPT	P43490	491 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	PTEN	P60484	403 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	TNMD	Q9H2S6	317 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	TRIO	O75962	3097 aa		27.55	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	GPR182	O15218	404 aa		27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	GIT2	Q14161	759 aa		27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	DDX12P	Q92771	950 aa		27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	STAM	Q92783	540 aa		27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	USP25	Q9UHP3	1055 aa		27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		27.54	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	SFI1	A8K8P3	1242 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CSPG5	O95196	566 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	SLFN14	P0C7P3	912 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	FGFR4	P22455	802 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	PEX3	P56589	373 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	DYM	Q7RTS9	669 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		27.53	■■■□□ 2
SKIL-208	ENST00000477216	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		27.53	■■■□□ 2

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