RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 SUSD6Q92537 303 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CASP10Q92851 521 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GBP3Q9H0R5 595 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ZBP1Q9H171 429 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 S1PR5Q9H228 398 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 FZD8Q9H461 694 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DNM3Q9UQ16 869 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 IPPQ9Y573 584 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MYH11P35749 1972 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ARL5CA6NH57 179 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PRR33A8MZF0 331 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 NRP1O14786 923 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 NR1I2O75469 434 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 POMCP01189 267 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PRPHP41219 470 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 NAMPTP43490 491 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ITIH3Q06033 890 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PPP2R5AQ15172 486 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MAPK6Q16659 721 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CES5AQ6NT32 575 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 POTEGQ6S5H5 508 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 RNF135Q8IUD6 432 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 KIFAP3Q92845 792 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CPB2Q96IY4 423 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TMX3Q96JJ7 454 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 IFT74Q96LB3 600 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GAD1Q99259 594 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 RNF39Q9H2S5 420 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 H3BQV1 296 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ACKR2O00590 384 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 N4BP3O15049 544 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LILRB3O75022 631 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CA8P35219 290 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MTHFRP42898 656 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 OR1G1P47890 313 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 EFNA5P52803 228 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DSC1Q08554 894 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 NBR1Q14596 966 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ECM1Q16610 540 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 KRT79Q5XKE5 535 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MCTP1Q6DN14 999 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GPR65Q8IYL9 337 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DEPTORQ8TB45 409 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 EDAQ92838 391 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MIOSQ9NXC5 875 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 HES2Q9Y543 173 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TECTAO75443 2155 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 K7ERI5 159 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 B4GALT5O43286 388 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 B4GALT3O60512 393 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 NPTXRO95502 500 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 EFEMP2O95967 443 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 C1RP00736 705 aa8.04□□□□□ -1.12
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