RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 PAK2Q13177 524 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAM9Q13443 819 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 LPIN1Q14693 890 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA1Q5VX52 437 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TTI2Q6NXR4 508 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 NOTUMQ6P988 496 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM228AQ86W67 206 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM174Q8WUU8 243 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 POMGNT1Q8WZA1 660 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TCHPQ9BT92 498 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 STYXL1Q9Y6J8 313 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GUA9 196 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 B4GALT5O43286 388 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 NR3C1P04150 777 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RAG1P15918 1043 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FGFR4P22455 802 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MCL1Q07820 350 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 KYAT1Q16773 422 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM114A1Q8IWE2 563 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM199Q8N511 208 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SEPT8Q92599 483 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 APBB2Q92870 758 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP63Q96MT8 703 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CBX8Q9HC52 389 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PADI3Q9ULW8 664 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0B4J269 797 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CLIC2O15247 247 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EVI5O60447 810 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOC3O60645 756 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 GNA14O95837 355 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EDN1P05305 212 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MCF2P10911 925 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PROZP22891 400 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 NR2F2P24468 414 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ADSSP30520 456 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CD52P31358 61 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2C18P33260 490 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL23P55773 120 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MBTPS1Q14703 1052 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 IQCB1Q15051 598 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A4Q6P5W5 647 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CPB2Q96IY4 423 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 THAP9Q9H5L6 903 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 DMAC2Q9NW81 257 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 USP20Q9Y2K6 914 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms