RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 KRT71Q3SY84 523 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 C18orf8Q96DM3 657 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ERLIN2O94905 339 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 COMTP21964 271 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 BIRC3Q13489 604 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PGM5Q15124 567 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PPP2R5EQ16537 467 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 C11orf63Q6NUN7 778 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SNX24Q9Y343 169 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PFASO15067 1338 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 COL4A5P29400 1685 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 WNT10BO00744 389 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MMEP08473 750 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 CHRNB2P17787 502 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PLTPP55058 493 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PSMC5P62195 406 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 RASA3Q14644 834 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 DUPD1Q68J44 220 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NLRP14Q86W24 1093 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 JAMLQ86YT9 394 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SEMA4DQ92854 862 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 BTBD6Q96KE9 485 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 RMDN3Q96TC7 470 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 LYPLA2O95372 231 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TMOD1P28289 359 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ADSSP30520 456 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NCKAP1LP55160 1127 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NSMFQ6X4W1 530 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PACS2Q86VP3 889 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 C4orf19Q8IY42 314 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 IWS1Q96ST2 819 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PSMD1Q99460 953 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ZSWIM1Q9BR11 485 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TBX20Q9UMR3 447 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PSME4Q14997 1843 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 CCNE2O96020 404 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SMTNP53814 917 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MFAP3P55082 362 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 CLUL1Q15846 466 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 FAM187AA6NFU0 413 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 DCDC2CA8MYV0 355 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 WDR64B1ANS9 1081 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SOX10P56693 466 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF16Q5VV41 709 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NIM1KQ8IY84 436 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TMEM174Q8WUU8 243 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NUP85Q9BW27 656 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 DENND3A2RUS2 1198 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 MAPK13O15264 365 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 SPOPO43791 374 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PHF2O75151 1096 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PPFIA2O75334 1257 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 KIAA0754O94854 1291 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 CNGA1P29973 690 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 NPTX2P47972 431 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 KRT39Q6A163 491 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 LPAR1Q92633 364 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 PYGMP11217 842 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-207ENST00000462494 JAK3P52333 1124 aa18.22■□□□□ 0.51
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