RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 INHBCP55103 352 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 NPEPPSP55786 919 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SPIDRQ14159 915 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 NIM1KQ8IY84 436 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 MB21D1Q8N884 522 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 FERMT2Q96AC1 680 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CLIP3Q96DZ5 547 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 IL17RAQ96F46 866 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 MSRAQ9UJ68 235 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 MYPNQ86TC9 1320 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 MFAP3LO75121 409 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 GAAP10253 952 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 RABGGTBP53611 331 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A3Q00325 362 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 OVOL3O00110 214 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PLIN1O60240 522 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PGBD4Q96DM1 585 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PRRX2Q99811 253 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ING3Q9NXR8 418 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 XDHP47989 1333 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 KIF3BO15066 747 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 STC2O76061 302 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC41Q15345 812 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR158Q5T848 1215 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 MNTQ99583 582 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 TSPAN6O43657 245 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CAND2O75155 1236 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS6KA4O75676 772 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ALDH1L1O75891 902 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ALDH1A2O94788 518 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 GNAT2P19087 354 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 OCRLQ01968 901 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 HTR3DQ70Z44 454 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 AHI1Q8N157 1196 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CHST12Q9NRB3 414 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 USP18Q9UMW8 372 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 NRP1O14786 923 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM20BO75063 409 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PFKMP08237 780 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PTGS2P35354 604 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 SCNN1BP51168 640 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 INHBEP58166 350 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 PHC1P78364 1004 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CD69Q07108 199 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF627Q7L945 461 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ST8SIA2Q92186 375 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.96□□□□□ -1.45
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A087X1B8 175 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-204ENST00000461653 LCHNA4D1U4 455 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-204ENST00000461653 LSP1P33241 339 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-204ENST00000461653 LSSP48449 732 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-204ENST00000461653 IL2P60568 153 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP2R5AQ15172 486 aa5.96□□□□□ -1.46
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