RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449194.6

PPHLN1-208, Transcript of periphilin 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPHLN1, Length 1,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPHLN1-208	ENST00000449194	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	DVL2	O14641	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	NAT1	P18440	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	IRF9	Q00978	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	RIN1	Q13671	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	DLG3	Q92796	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPHLN1-208	ENST00000449194	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	A2M	P01023	1474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GC	P02774	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	EVA1C	P58658	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	STIL	Q15468	1287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194		Q6ZPA2	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	RNF180	Q86T96	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	UBR7	Q8N806	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	HAS1	Q92839	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PZP	P20742	1482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TRAF5	O00463	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	RGS3	P49796	1198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	HERVK_113	P62684	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	HGFAC	Q04756	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	KIF14	Q15058	1648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	OPA1	O60313	960 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SCNN1G	P51170	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	KIF11	P52732	1056 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ANTXR2	P58335	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	COL10A1	Q03692	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ADAM15	Q13444	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MSH6	P52701	1360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SLC9A1	P19634	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ADRA1B	P35368	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194		Q6ZRM9	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	HIP1R	O75146	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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