RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443509.6

PRUNE2-208, Transcript of prune homolog 2, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PRUNE2, Length 12,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRUNE2-208	ENST00000443509	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYP27B1	O15528	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RCN2	Q14257	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	EHD4	Q9H223	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	C5	P01031	1676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM107A	O95990	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CP	P00450	1065 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	A1BG	P04217	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GNAT1	P11488	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PAX7	P23759	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	STIL	Q15468	1287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC22	O60826	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FBLN1	P23142	703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FOXO4	P98177	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MATN2	O00339	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TNNC2	P02585	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GTF2H1	P32780	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPP4C	P60510	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509		H7C0S8	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	GHR	P10912	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCND2	P30279	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	VPS16	Q9H269	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	C21orf2	O43822	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FSBP	O95073	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PDHA1	P08559	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	LRPAP1	P30533	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	HMOX2	P30519	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	CNGA3	Q16281	694 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	BCL9	O00512	1426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	KRT31	Q15323	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRUNE2-208	ENST00000443509	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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