RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ZNF292O60281 2723 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CACNA1AO00555 2505 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WZ62 844 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 STK25O00506 426 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 FGFR4P22455 802 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ANGPT1Q15389 498 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 DTWD2Q8NBA8 298 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A3Q8WY07 619 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF25Q93038 417 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
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PRAME-210ENST00000442481 WNT16Q9UBV4 365 aa13□□□□□ -0.33
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PRAME-210ENST00000442481 KIF3AQ9Y496 699 aa13□□□□□ -0.33
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PRAME-210ENST00000442481 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PI15O43692 258 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GAS2O43903 313 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MAFO75444 373 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
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PRAME-210ENST00000442481 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 C1RP00736 705 aa12.99□□□□□ -0.33
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PRAME-210ENST00000442481 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 HACE1Q8IYU2 909 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SIX5Q8N196 739 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 HDAC7Q8WUI4 952 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 LPPQ93052 612 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NLRP4Q96MN2 994 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MBOAT7Q96N66 472 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 KLHL5Q96PQ7 755 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NEMFO60524 1076 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GLUD1P00367 558 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SOD2P04179 222 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CNPP09543 421 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NPR3P17342 541 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GJB2P29033 226 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MCM7P33993 719 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SLC11A1P49279 550 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PSMC5P62195 406 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CREMQ03060 361 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CALCRLQ16602 461 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 UGCGQ16739 394 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MCTP1Q6DN14 999 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 BORCS6Q96GS4 357 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 MAN1C1Q9NR34 630 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12.98□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 H3BQV1 296 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 WNT7AO00755 349 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 GLUD2P49448 558 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 DRP2Q13474 957 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CUL4AQ13619 759 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TCP11Q8WWU5 503 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CCDC51Q96ER9 411 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 FAM20AQ96MK3 541 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 RPS6KC1Q96S38 1066 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 EPS15L1Q9UBC2 864 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 CLUHO75153 1309 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 EML1O00423 815 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TBX3O15119 743 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ASAP2O43150 1006 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 ERLIN2O94905 339 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 SRFP11831 508 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 AXLP30530 894 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 RFC5P40937 340 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-210ENST00000442481 TXKP42681 527 aa12.96□□□□□ -0.33
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