RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACCSQ96QU6 501 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAM2Q99965 735 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM206Q9H813 350 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LTBP2Q14767 1821 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARID2Q68CP9 1835 aa8.96□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALPK3Q96L96 1907 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0B4J269 797 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF623O75123 536 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF20AO95235 890 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC34A2O95436 690 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AMHP03971 560 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCF2P10911 925 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BMP6P22004 513 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXD13P35453 343 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB27AP51159 221 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNA1Q09470 495 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MORC3Q14149 939 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHHQ15465 462 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPB2Q96IY4 423 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC9A7Q96T83 725 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GDAQ9Y2T3 454 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.95□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PPC1 479 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EOMESO95936 686 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADSSP30520 456 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R2P41236 205 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNJ6P48051 423 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIG4P49917 911 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCL1Q07820 350 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TDHQ8IZJ6 230 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOP1MTQ969P6 601 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BICD1Q96G01 975 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GBP3Q9H0R5 595 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP20Q9Y2K6 914 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBBXA8MT70 800 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDXKO00764 312 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INPPL1O15357 1258 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLDN3O15551 220 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TGFB1I1O43294 461 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM189A1O60320 539 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPTXRO95502 500 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STAG3L1P0CL83 205 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms