RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAPK13	O15264	365 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDUFB5	O43674	189 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLRC4	O43908	158 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TLR2	O60603	784 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.21	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OPHN1	O60890	802 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DEXI	O95424	95 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAL	P42357	657 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CROCCP2	Q86T23	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	P2RX5	Q93086	422 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRP5	O75197	1615 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A087X0T9	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT38	O76015	456 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM228B	P0C875	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAC1	P20366	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGFR4	P22455	802 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCNE1	P24864	410 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFKBIA	P25963	317 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STX2	P32856	288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARFIP2	P53365	341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GLG1	Q92896	1179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNX27	Q96L92	541 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXN2	P32314	431 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGS2	P41220	211 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLCN2	P51788	898 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPAA1	O43292	621 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BMP15	O95972	392 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COPB2	P35606	906 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VPS41	P49754	854 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDR2	Q01850	454 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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