RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 SRRDQ9UH36 339 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 RCAN3Q9UKA8 241 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MYPNQ86TC9 1320 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 K7ESF4 209 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 DAPK3O43293 454 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FZD7O75084 574 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF202O95125 648 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PFKMP08237 780 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 VSIG10L2P0DP72 767 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 OSMP13725 252 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ENPP1P22413 925 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ACVRL1P37023 503 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 GPR3P46089 330 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 EPHB1P54762 984 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 PTH1RQ03431 593 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 MIIPQ5JXC2 388 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 HOOK2Q96ED9 719 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 UIMC1Q96RL1 719 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 HIST1H2AJQ99878 128 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TCF25Q9BQ70 676 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 TNKSO95271 1327 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 LY86O95711 162 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MTHFD2P13995 350 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CASRP41180 1078 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KIR2DL3P43628 341 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PTTG1IPP53801 180 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 LGALS4P56470 323 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CCT2P78371 535 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CDK17Q00537 523 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FKBP15Q5T1M5 1219 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 RAX2Q96IS3 184 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 IP6K2Q9UHH9 426 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 NUMBLQ9Y6R0 609 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 HMGA2P52926 109 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SLC5A3P53794 718 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 NPEPPSP55786 919 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 NRG3P56975 720 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-208ENST00000427110 MCL1Q07820 350 aa3.22□□□□□ -1.89
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