RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 RPAINQ86UA6 219 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35C1Q96A29 364 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 KCND1Q9NSA2 647 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 AKT3Q9Y243 479 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.46□□□□□ -0.73
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HDLBP-211ENST00000425989 PRKCBP05771 671 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC172P0C7W6 258 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
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HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 GRK4P32298 578 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 KRT9P35527 623 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 SOX10P56693 466 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN10P78369 228 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.46□□□□□ -0.73
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HDLBP-211ENST00000425989 KSR1Q8IVT5 923 aa10.46□□□□□ -0.73
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HDLBP-211ENST00000425989 TC2NQ8N9U0 490 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 TCHPQ9BT92 498 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 SETD4Q9NVD3 440 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 CEP72Q9P209 647 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-211ENST00000425989 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.46□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 SIP14410 1827 aa10.46□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 TTC26A0AVF1 554 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.45□□□□□ -0.74
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 MFAP3LO75121 409 aa10.45□□□□□ -0.74
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HDLBP-211ENST00000425989 CYP2C9P11712 490 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 CASP14P31944 242 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 FMO5P49326 533 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 GPC3P51654 580 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 CLCN3P51790 818 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 MCL1Q07820 350 aa10.45□□□□□ -0.74
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HDLBP-211ENST00000425989 DRP2Q13474 957 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 PSMD6Q15008 389 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 KRT39Q6A163 491 aa10.45□□□□□ -0.74
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HDLBP-211ENST00000425989 CYP26C1Q6V0L0 522 aa10.45□□□□□ -0.74
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HDLBP-211ENST00000425989 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.45□□□□□ -0.74
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HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WZ62 844 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GUA9 196 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 M0QZ92 97 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 CAND2O75155 1236 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 GYPCP04921 128 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 ASGR1P07306 291 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 MCF2P10911 925 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 PROZP22891 400 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-211ENST00000425989 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 26.8
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