RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 TOM1L1O75674 476 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 HOXD13P35453 343 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 FAM189BP81408 668 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 KCNA1Q09470 495 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 UBXN11Q5T124 520 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 CPB2Q96IY4 423 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF623O75123 536 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 RAB27AP51159 221 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MORC3Q14149 939 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 NFKBIBQ15653 356 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 USP20Q9Y2K6 914 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 GDAQ9Y2T3 454 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 KIF20AO95235 890 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SKIP12755 728 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 BMP6P22004 513 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 LIG4P49917 911 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MCL1Q07820 350 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SHHQ15465 462 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 AMHP03971 560 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 KCNJ6P48051 423 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 BICD1Q96G01 975 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SLC9A7Q96T83 725 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 CDT1Q9H211 546 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 TGFB1I1O43294 461 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 EOMESO95936 686 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 MCF2P10911 925 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 DEFB103AP81534 67 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TOP1MTQ969P6 601 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 GBP3Q9H0R5 595 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 LAMA3Q16787 3333 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 A0A0B4J269 797 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ZBBXA8MT70 800 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 CLDN3O15551 220 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ADSSP30520 456 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PPP1R2P41236 205 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TDHQ8IZJ6 230 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 IPPQ9Y573 584 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms