RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 TMC2Q8TDI7 906 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 PMM2O15305 246 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ADCY3O60266 1144 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 FERP16591 822 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 SOX5P35711 763 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 MNS1Q8NEH6 495 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TCP11Q8WWU5 503 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 EXTL3O43909 919 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 HBP1O60381 514 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 EVI5O60447 810 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD7Q92527 254 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 CDC23Q9UJX2 597 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 MOCS3O95396 460 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 LGALS2P05162 132 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 RFX1P22670 979 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF233A6NK53 670 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ENC1O14682 589 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 AMPD2Q01433 879 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT39Q6A163 491 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 PPTC7Q8NI37 304 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 AFG1LQ8WV93 481 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 SEMA4DQ92854 862 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TINF2Q9BSI4 451 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TADA3O75528 432 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ELF2Q15723 593 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ENPEPQ07075 957 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 SMPD1P17405 629 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF2H1P32780 548 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ACOT2P49753 483 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 TUBB2AQ13885 445 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 USP37Q86T82 979 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF149Q8NC42 400 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.334e-6■■■■■ 106.6
SH3BP5-204ENST00000412806 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 NENFQ9UMX5 172 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 TACC1O75410 805 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF286BP0CG31 522 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ANXA13P27216 316 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 WNT7BP56706 349 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ACVR2BQ13705 512 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms