RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410983.1

RNU6-564P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 564, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-564P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-564P-201ENST00000410983 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 GAAP10253 952 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC5A1P13866 664 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 SERPINB3P29508 390 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 SRLQ86TD4 932 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 UIMC1Q96RL1 719 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 POLHQ9Y253 713 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-564P-201ENST00000410983 A0A088AWK7 358 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 COL6A1P12109 1028 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PEX2P28328 305 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ECHS1P30084 290 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 STAT5BP51692 787 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 KCNQ1P51787 676 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 EPHB3P54753 998 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PER3P56645 1201 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 GPSM2P81274 684 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 UBE3CQ15386 1083 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 LONRF1Q17RB8 773 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 C3orf20Q8ND61 904 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 TDP1Q9NUW8 608 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 VWA7Q9Y334 891 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 CFAP69A5D8W1 941 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 MGEA5O60502 916 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 SEMA7AO75326 666 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 POLD1P28340 1107 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 LIMS1P48059 325 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 CDC42EP1Q00587 391 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 APOL5Q9BWW9 433 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 SGPP1Q9BX95 441 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARIH2O95376 493 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 IL13P35225 146 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC6A9P48067 706 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 HK3P52790 923 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAB1AP62820 205 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 NOGQ13253 232 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 FGL2Q14314 439 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 Q6ZVL8 140 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 RSPH3Q86UC2 560 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBCBQ99426 244 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARMT1Q9H993 441 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 KCNK12Q9HB15 430 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 H3BUI4 141 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 HMGCRP04035 888 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ITGB5P18084 799 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ETV4P43268 484 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 MST1LQ2TV78 715 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PRR31Q5SQ13 230 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 KRT78Q8N1N4 520 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF480Q8WV37 535 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAB24Q969Q5 203 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 PGBD4Q96DM1 585 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-564P-201ENST00000410983 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms