RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 SELPP16109 830 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PTENP60484 403 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EHHADHQ08426 723 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MGAT3Q09327 533 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PSMD2Q13200 908 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 KCNJ12Q14500 433 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 KRT31Q15323 416 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 DPF3Q92784 378 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FIZ1Q96SL8 496 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 OSMRQ99650 979 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 BICDL2A1A5D9 508 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EVI5O60447 810 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 IQCF3P0C7M6 154 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CYP2C18P33260 490 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PHKA2P46019 1235 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 K7ERI5 159 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 N4BP3O15049 544 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TIMP1P01033 207 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CCNE1P24864 410 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 EFNA5P52803 228 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 NCKAP1LP55160 1127 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CCL23P55773 120 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 STK4Q13043 487 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CNGA4Q8IV77 575 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 DENND3A2RUS2 1198 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 H0YCG3 227 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 GCNT3O95395 438 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 RAG1P15918 1043 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FECHP22830 423 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ITGB8P26012 769 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TTI2Q6NXR4 508 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF592Q92610 1267 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 P2RX5Q93086 422 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 K7ENM7 598 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MFAP3LO75121 409 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MYBP10242 640 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SCP2P22307 547 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 CASP5P51878 434 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 GTF2BQ00403 316 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 LPIN1Q14693 890 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 MBTPS1Q14703 1052 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SCLYQ96I15 445 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 STRA6Q9BX79 667 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 FZD8Q9H461 694 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 SQORQ9Y6N5 450 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-204ENST00000409441 A0A1W2PQC6 194 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms